Departamento de Biologia
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Browsing Departamento de Biologia by Field of Science and Technology (FOS) "Ciências Médicas::Outras Ciências Médicas"
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- Actividades biológicas e metabolitos secundários de espécies marinhas exóticas dos AçoresPublication . Bettencourt, Ana Margarida Lemos; Barreto, Maria do Carmo; Seca, Ana Maria LoureiroNeste trabalho avaliou-se o potencial farmacológico dos extractos de algumas espécies invasoras/exóticas dos Açores, Asparagopsis armata, Asparagopsis taxiformis, Codium fragile subsp. fragile, Microscosmus squamiger, Bugula neritina, Tricellaria inopinata e Zoobotryon verticillatum, colhidos em marinas de Santa Maria (SMA) e São Miguel (SMI). [...].
- Análise das infeções por microrganismos resistentes aos Carbapenemes no Hospital do Divino Espírito SantoPublication . Taveira, Bernardete Alves; Silva, Luís Filipe Dias; Barreto, Maria do CarmoINTRODUÇÃO: A emergência e disseminação global de Enterobacteriaceae resistentes aos carbapenemes (CRE) constituem ameaças à saúde pública, estando associadas a um aumento das taxas de morbilidade e mortalidade, com particular relevância em doentes imunodeprimidos ou portadores de múltiplas patologias. Testes de sensibilidade aos antimicrobianos evidenciam um incremento de resistências destas bactérias, em virtude da variedade de mecanismos de resistência adquiridos. Em Portugal destaca-se Klebsiella pneumoniae da família das Enterobacteriaceae, associada maioritariamente a infeções urinárias. […]. RESULTADOS: Foram detetados 80 doentes, apresentando uma média de idade de 67,8 anos com ligeiro predomínio do género masculino, a maioria apresentando múltiplas patologias. Os casos foram maioritariamente associados a infeções urinárias (33,8%), mas incluindo igualmente colonizações (38,8%). Klebsiella pneumoniae foi detetada em 56,3% dos casos. Os antibióticos mais utilizados no tratamento destas infeções foram a ciprofloxacina (12,5%) e o meropenem (12,5%), tendo sido atribuída a designação de CRE a estas infeções sobretudo por resistência ao ertapenem (90%). […].
- Caracterização bioquímica e molecular de enzimas trombolíticas obtidas de isolados microbianos dos AçoresPublication . Gulamo, Caterina Machado; Simões, Nelson José de Oliveira; Toubarro, Duarte NunoBacillus sp. present a great diversity and a high productivity of protease. The group of Biotechnology Department of the Universidade dos Açores has a microbial isolates bank which includes about 1600 isolates of Bacillus sp. Some of the biggest potential thrombolytic enzymes are isolated from Bacillus sp. (streptokinase and natokinase). In this work we tested 79 isolates, previous tested to find a thrombolytic enzyme. The 79 isolates were tested for proteolytic activity in agar casein plate. Then the fibrinolytic activity and the thrombolytic activity of selected isolates were tested. Was determinate the group species of the bacterial isolates with higher activity and were selected 1 isolate from each group. The optimal pH and the optimal temperature of the extracellular protease produced by 11 isolates from Bacillus sp. were determinate also. A hemolytic test was made to the enzymes with a higher thrombolytic activity. After we check for fibrinolytic, thrombolytic and hemolytic activity were selected 2 isolates. These 2 isolates were tested for aPTT and PT activity, for plasminogen activator activity, fibrinogenolytic activity and euglobulin lysis time. 1 bacterial enzyme was selected for biochemical characterization and purification. From the 79 isolates with high proteolytic activity 27 were chosen by their high activity in pH 7.5 and 37˚C. From these 27 bacterial isolates 11 were spotted with fibrinolytic activity and thrombolytic activity (just 6% of the initial 79 isolates). 4 of these enzymes (S97B, S88A, S178C and 99D) belongs to Bacillus cereus group, 4 belongs to Bacillus mycoides group (S101C, S115C, S26A and S62A) and 3 belongs to Bacillus subtilis group (S157E, S122C and S150C). Were selected 2 isolates from the Bacillus mycoides group (S115C and S101C) because they didn’t present hemolytic activity. The isolate S115C didn’t interfere with aPPT test neither with PT test, otherwise S101C increase the aPPT, interfering with the normal coagulation time. Was also evidence that S101C is a plasminogen activator (t-PA) and S115C is not. Moreover, S115C presented more than 10x fibrinolytic activity then S101C, thus enzyme S115C was selected for biochemical characterization and purification. Biochemical characterization showed that S115C was a high inhibited by Benzamidine, STI, Chymostatin and PTCK indicating that S115C is a chymotrypsin-like serine protease. Suc-Ala-Ala- Pro-Phe-pNa was a specific substrate which indicates chymotrypsin activity. The activity of these enzyme was highly enhanced by Mn and slightly enhanced by Na and Ca2. This enzyme was inhibited by metal ions Mg2+, Cu+ and Ni2+. The zymogram of the purified enzyme revel a digestion band higher than 135 kDa and another band at 75kDa. SDS-page of purified fraction revel 2 bands one at 75 kDa and another at 140kDa. The SDS-page bands were cut and sent to analysis of mass spectrometry (Ms/Ms).
- Caracterização do cancro da cavidade oral e orofaringe da população das ilhas de São Miguel e Santa MariaPublication . Pacheco, Maria Carolina Cabral; Lima, Maria Manuela de Medeiros; Rodrigues, Armindo dos Santos; Carneiro, Victor Manuel DiasA incidência do cancro da cavidade oral e orofaringe (CCOO) tem aumentado mundialmente. A presença do vírus do Papiloma humano (HPV) na cavidade oral e orofaringe, está associada ao desenvolvimento de carcinomas e está relacionada com melhor prognóstico quando comparados com os carcinomas HPV negativos, tornando-se, pois, importante individualizar estes casos de forma a poder delinear no futuro estratégias terapêuticas diferentes para estes pacientes. Este estudo tem por objectivo conhecer a epidemiologia do CCOO, das populações das ilhas de São Miguel e Santa Maria, no período entre 2007 a 2016 e caracterizar, quanto à presença do HPV ativo, um subgrupo de carcinomas espinocelulares da orofaringe. Para determinar a presença de integração do DNA viral nas células do hospedeiro, foram realizados dois métodos, o método molecular o HPV Direct Flow CHIP KIT, e o método imunohistoquimico de avaliação da sobrexpressão da proteína P16INK4a. Para avaliar os fatores epidemiológicos utilizou-se a informação disponível nas requisições que os médicos enviam para o Serviço de Anatomia patológica do Hospital do Divino Espírito Santo e nos ficheiros clínicos dos pacientes. Este estudo concluiu que o carcinoma espinocelular representa cerca de 90% de todos CCOO na região, e afeta 10 vezes mais homens do que mulheres. O presente estudo revelou que a incidência do CCOO em Santa Maria é 3 vezes maior que a média nacional e, pela primeira vez, foi demonstrado que o consumo de tabaco está associado ao cancro da cavidade oral e o consumo de álcool está associado ao cancro da orofaringe. Os hábitos de estilo de vida estão, na região, na origem do CCOO e o HPV não tem um envolvimento significativo no desenvolvimento deste.
- Composição química e atividades biológicas do óleo essencial de diferentes partes de Cryptomeria japonica dos AçoresPublication . Janeiro, Alexandre Pavão; Lima, Elisabete Maria de Castro; Baptista, José António Bettencourt; Rosa, José Silvino SantosNa presente tese foram determinadas a composição química e algumas bioatividades dos óleos essenciais (OEs) extraídos por hidrodestilação (HD) de diferentes partes de Cryptomeria japonica dos Açores, nomeadamente: ramada fresca (RF), ramada seca (RS), galhos secos (GS), cones femininos secos (CFS) e folhas secas (FS). Esses parâmetros foram comparados com os de um OE comercial (OEC) de C. japonica dos Açores. Foram ainda calculados os rendimentos dos OEs extraídos por HD. De modo a avaliar a toxicidade de cada um dos OEs, foi realizado um ensaio de dose única em Artemia salina. Foram também testados vários padrões, nomeadamente: α-pineno, β-pineno, limoneno e terpineol. Das amostras analisadas, apenas 4 mostraram taxas de mortalidade acima dos 50% ao fim de 24 h, sendo limoneno (89,0%), CFS (61,7%), GS (55,7%) e α-pineno (50,0%). Para estas amostras foram determinadas a dose letal 50% (DL₅₀) e 90% (DL₉₀). A amostra mais tóxica foi CFS (DL₅₀ = 81,06 ppm; DL₉₀ = 120,21 ppm), enquanto que o limoneno (DL₅₀ = 58,73 ppm; DL₉₀ = 90,32 ppm) foi o padrão mais tóxico. Foram também avaliadas as propriedades antimicrobianas (atividade antibacteriana contra Bacillus subtilis, Micrococcus luteus, Escherichia coli e Enterobacter cloacae e actividade antifúngica contra Penicillium sp.) de cada um dos OEs, bem como de 6 padrões (os 4 acima referidos, o terpinen-4-ol e o α-terpineol). Relativamente à atividade antibacteriana, o OE mais ativo foi o de CFS (halos de inibição entre 10 mm e 14,7 mm) contra todas as bactérias exceto E. coli. Por outro lado, nenhum OE mostrou atividade contra Penicillium sp.. Dos padrões testados, o terpinen-4-ol foi o mais ativo contra todos os microrganismos, com halos de inibição entre 9 mm e 72,5 mm. Consultando a literatura, verificou-se que os OEs de C. japonica de outras origens geográficas têm menor quantidade de terpinen-4-ol que o OE de C. japonica dos Açores, particularmente galhos e cones femininos. Assim, estes resultados revelam uma potencial fonte de biocidas, valorizando os resíduos verdes de C. japonica açoriana. De realçar, também, que o OE dos cones femininos de C. japonica, ainda muito pouco estudado, apresentou um elevado rendimento de extração.
- Deteção da atividade anticancerígena de extratos usados na medicina tradicional chinesaPublication . Almeida, Ricardo Jorge Ferreira; Barreto, Maria do CarmoNas últimas décadas, as terapias direcionadas para o tratamento do cancro apontam para o desenvolvimento de uma medicina personalizada. Apesar dos avanços tecnológicos, a taxa de sobrevivência para alguns tipos de cancros avançados ou recorrentes ainda é insatisfatória, sendo nestes casos o objetivo de tratamento o prolongamento da sobrevida, com qualidade de vida. Desta forma, a procura de medicinas alternativas e complementares têm aumentado nos últimos tempos. A Medicina Tradicional Chinesa (MTC) é uma das medicinas complementares mais utilizadas em todo mundo em pacientes com cancro. A função terapêutica da fitoterapia é mais abrangente, permitindo reforçar e aumentar a resistência endógena do corpo perante a doença e reduzir os efeitos secundários do tratamento por quimioterapia e radioterapia. No entanto, os mecanismos de atuação da fitoterapia usada na MTC permanecem pouco compreendidos e a sua ação terapêutica ainda não foi totalmente esclarecida. O presente trabalho teve como objetivo avaliar atividades biológicas indicativas de efeito antitumoral em extratos de plantas ou preparados usados como anticancerígenos na MTC: Mentha haplocalyx (Bo He), Amomi fructus (Sha Ren), Triticum aestivum carpopsis (Fu Xiao Mai) e Fossilia ossis mastodi (Long gu). As atividades testadas foram as antioxidantes, através do método de remoção dos radicais DPPH• e ABTS•+ e pela redução do Cloreto de Ferro, as atividades antiinflamatórias pela desnaturação da albumina e inibição da protease tripsina, e as atividades antitumoral in vitro contra células A549 (carcinoma humano de pulmão). Testou-se ainda a toxicidade dos extratos contra Artemia salina. Constatou-se que os extratos de Mentha haplocalyx e Amomi fructus obtiveram atividades muito significativas em todos os ensaios que foram testados, com valores próximos dos controlos. O extrato de Mentha haplocalyx apresentou uma atividade superior ao controlo na inibição da desnaturação da albumina e teve uma atividade citotóxica muito relevante contra células tumorais A549. O extrato de Triticum aestivum carpopsis demonstrou a maior percentagem de inibição de células tumorais A549, com um valor de inibição de 94,9%, apresentando também boa atividade na proteção da desnaturação de albumina e demonstrou alguma atividade antioxidante. O extrato de Fossilia ossis mastodi apresentou atividade anti-inflamatória relevante, próxima dos valores dos restantes extratos. Contudo, demonstrou uma atividade citotóxica baixa e não foi observada nenhuma atividade antioxidante. Nenhum dos extratos provocou qualquer efeito letal sobre Artemia salina até concentração máxima testada, sugerindo que estes extratos não têm toxicidade significativa em organismos multicelulares. Estes resultados confirmam o interesse da utilização de Mentha haplocalyx e Amomi fructus como coadjuvantes no tratamento do cancro, e são promissores para uma nova perspetiva de abordagem no tratamento desta patologia.
- Deteção do potencial cianotóxico em águas superficiais do Arquipélago dos Açores através de métodos molecularesPublication . Cordeiro, Rita Isabel Pereira; Fonseca, Maria Amélia Oliveira Gonçalves; Gonçalves, Vitor Manuel da Costa[...]. Com o objetivo de detetar o potencial de produção de saxitoxina, anatoxina-a e microcistina nas lagoas da ilha de São Miguel (Açores), colheram-se amostras mensais de 14 lagoas, analisando-se a presença de cianobactérias (gene produtor da ficocianina: PC-IGS) e de genes produtores de saxitoxina (stxA), anatoxina-a (anaC) e microcistina (mcyA, mcyB, mcyC, mcyD, mcyE e mcyG), através de técnicas moleculares (PCR). Simultaneamente procedeu-se ao isolamento e cultivo de espécimes presentes nestas amostras para avaliar a distribuição destes genes nas espécies existentes. [...].
- Development of triplet repeat primed PCR (TP-PCR) technique as a support of molecular test in Machado-Joseph diseasePublication . Melo, Ana Rosa Vieira; Lima, Manuela; Reche, Amanda Ramos[...]. Este estudo teve como objetivo o desenvolvimento e a validação de um protocolo de TPPCR para a DMJ. Sessenta e seis amostras de sangue previamente genotipadas por PCR foram utilizadas na otimização e validação da TP-PCR. A robustez da técnica foi testada em 14 amostras de esfregaço bucal de doentes heterozigóticos com um alelo expandido. Os resultados da TP-PCR foram concordantes com os obtidos pela PCR em 65 amostras de sangue. Os resultados obtidos para as amostras de esfregaço bucal foram 100% concordantes com os das amostras de sangue, demostrando que a técnica pode ser aplicada em diferentes tecidos e para uma baixa quantidade de DNA. A TP-PCR desenvolvida e validada para a DMJ deverá constituir uma técnica complementar fiável em laboratórios de diagnóstico, de modo a ultrapassar as limitações da PCR, relacionadas com a falha de amplificação dos alelos expandidos.
- Estudo de atividades antimicrobianas em bactérias do género Bacillus isoladas nos Açores : otimização das condições de produção, identificação e caracterização de bacteriocinasPublication . Machado, Sara Isabel Goulart; Cabral, Carla Manuela Machado Mendes LeiteOs Bacillus sp. produzem péptidos antimicrobianos incluindo bacteriocinas que são péptidos de síntese ribossomal. As bacteriocinas têm originado um grande interesse em várias áreas, desde a saúde humana até à indústria alimentar. Este trabalho teve como objetivo a seleção de 5 isolados de Bacillus sp. do Coleção de Bactérias Esporulantes dos Açores e a otimização das condições de crescimento e a maximização da produção da atividade antimicrobiana em meio liquido de 1 destes isolados, assim como a caracterização e purificação parcial das moléculas ativas. [...].
- Otimização da seleção embrionária em técnicas de reprodução medicamente assistida : um estudo por «time-lapse»Publication . Viegas, Cíntia Oliveira de Zuzarte; Cabral, Graça Maria Quental Costa Lima; Lima, Maria Manuela de Medeiros; Brilhante, Maria de Fátima AlmeidaAs técnicas de reprodução medicamente assistida permitem o tratamento de casais inférteis, proporcionando-lhes a possibilidade de constituir família e de exercer a parentalidade. Todavia, o recurso a estas técnicas tem contribuído, ao longo dos anos, para o aumento do número de gravidezes múltiplas, as quais estão associadas a riscos para a saúde materno-fetal e, como tal, devem ser minimizadas através da transferência de um único embrião. Deste modo, torna-se pertinente implementar em laboratório métodos e tecnologias que contribuam para a seleção do embrião com maior potencial de implantação. A monitorização do desenvolvimento embrionário com recurso à tecnologia de “time-lapse” é uma técnica não invasiva que permite, através da visualização de um vídeo, uma avaliação constante e sequencial dos parâmetros morfocinéticos do desenvolvimento embrionário. Através desta tecnologia torna-se, assim, possível identificar parâmetros morfocinéticos preditores da implantação e aplicar algoritmos de seleção embrionária. Apesar de estarem reportados na literatura parâmetros morfocinéticos preditores do potencial de implantação embrionário, bem como algoritmos de seleção embrionária, a universalidade desses parâmetros não está ainda demonstrada, cabendo a cada laboratório de reprodução medicamente assistida fazer a sua própria validação. O objetivo deste trabalho foi, assim, validar parâmetros morfocinéticos preditores do potencial de implantação e algoritmos de seleção embrionária em “time-lapse” no laboratório de reprodução medicamente assistida da MekaCenter – Clínica da Mulher, de modo a propor estratégias de otimização de seleção embrionária, usando a tecnologia de “time-lapse”. Com vista a atingir este objetivo foram selecionados 106 ciclos de tratamento FIV/ICSI monitorizados por “time-lapse”, registados entre 2014 e 2018 e relativos a 89 casais que recorreram, na MekaCenter, a técnicas de reprodução medicamente assistida. A partir dos 106 ciclos, foram selecionadas 132 transferências de um ou dois embriões, realizadas em dia 3 de desenvolvimento embrionário e com um resultado de implantação conhecido, envolvendo um total de 209 embriões com “Known Implantation Data” (KID). Foram recolhidos dados demográficos e do estilo de vida de cada casal, assim como dados clínicos referentes aos ciclos e às transferências embrionárias. Foram anotados, retrospetivamente, um total de 21 parâmetros morfocinéticos relativos aos 209 embriões. Finalmente, foram aplicados à amostra embrionária dois algoritmos de seleção — o KIDScore e o Basile — com o intuito de determinar a sua capacidade preditiva. Neste trabalho, os parâmetros morfocinéticos identificados como possíveis preditores do potencial de implantação embrionário foram: o tempo de clivagem da 5ª, 6ª e 9ª célula (t5, t6, t9); a duração da clivagem de 4 para 5 células (cc3a); e a clivagem direta. Destes parâmetros morfocinéticos, verificou-se que existem dados previamente validados por outros estudos que corroboram a relevância clínica de t5 e da clivagem direta, pelo que estes são parâmetros a considerar aquando da seleção embrionária. Relativamente à capacidade preditiva dos algoritmos de seleção embrionária aplicados à amostra, foi obtido para o KIDScore um valor da área abaixo da curva ROC (AUC) de 0,659 e para o Basile um valor de AUC de 0,691. Quanto à comparação do desempenho destes dois algoritmos, verificou-se que a diferença entre a AUC dos algoritmos foi de 0,032, o que determina que ambos têm um desempenho similar. Deste modo, ambos os algoritmos podem ser utilizados no laboratório da MekaCenter, dado não haver discrepâncias relevantes entre os valores de AUC obtidos neste trabalho e os publicados cientificamente. Quanto à associação entre os dados clínicos, demográficos e do estilo de vida dos casais e a implantação embrionária, identificou-se como variáveis preditoras: a idade da mulher (OR=0.747), estando a idade avançada da mulher associada a um menor potencial de implantação; a idade do homem (OR=1.310), onde o aumento da idade determinou, contrariamente ao que seria esperado, um aumento nas hipóteses de implantação; o número de oócitos recolhidos (OR=1.182), estando um maior número de oócitos recolhidos associado a um aumento das hipóteses de implantação; e o número de embriões transferidos (OR=0.083), onde se verificou que as transferências de um único embrião estão associadas a um maior potencial de implantação embrionário. O presente trabalho permitiu encontrar estratégias orientadoras da classificação e seleção embrionária em “time-lapse” através da validação de parâmetros morfocinéticos e de algoritmos de seleção embrionária. Assim, propõe-se a integração dos algoritmos de seleção embrionária, no laboratório da MekaCenter, durante a monitorização por “time-lapse” do desenvolvimento embrionário, com o intuito de selecionar um único embrião a transferir.