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CaracterizaĆ§Ć£o molecular de Listeria monocytogenes ser. 4b por Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP)
| dc.contributor.advisor | Pintado, Cristina Maria Baptista Santos | |
| dc.contributor.advisor | Ferreira, Maria AdƩlia da Silva Santos | |
| dc.contributor.author | GoulĆ£o, Maria Manuela Martins Francisco | |
| dc.date.accessioned | 2011-03-31T10:23:03Z | |
| dc.date.available | 2011-03-31T10:23:03Z | |
| dc.date.issued | 2011-03-03 | |
| dc.description | DissertaĆ§Ć£o de Mestrado em Engenharia ZootĆ©cnica. | por |
| dc.description.abstract | O serotipo maioritariamente associado Ć s estirpes de Listeria monocytogenes isoladas de queijos Portugueses pertence ao serotipo 4b, o qual estĆ” referido na literatura como o responsĆ”vel pelo maior nĆŗmero de casos de listeriose humana. Tendo em conta a importĆ¢ncia de que se revestem estas estirpes, a sua caracterizaĆ§Ć£o usando mĆ©todos mais discriminatĆ³rios que a serotipagem Ć© de crucial importĆ¢ncia. Assim, o presente estudo teve por finalidade a caracterizaĆ§Ć£o molecular de estirpes de L. monocytogenes ser. 4b, isoladas de queijos de diferentes zonas do paĆs, e uma primeira avaliaĆ§Ć£o da distribuiĆ§Ć£o geogrĆ”fica dos tipos moleculares encontrados. Foi usado o mĆ©todo Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) com base no protocolo que se encontra em funcionamento no Health Protection Agency Department of Gastrointestinal Infections / Centre for Infections, em Londres. Para a anĆ”lise da similaridade entre estirpes recorreu-se ao programa Bionumerics. O poder discriminatĆ³rio do mĆ©todo AFLP foi calculado atravĆ©s do Ćndice de Simpson. Das 47 estirpes de L. monocytogenes ser. 4b tipadas neste trabalho resultaram 6 perfis diferentes com um nĆŗmero de bandas compreendido entre 5 a 7 no intervalo entre 500 bp e 1500 bp. Todos os perfis AFLP apresentaram uma banda comum de aproximadamente 850 bp. O poder discriminatĆ³rio do mĆ©todo AFLP foi avaliado em 0,70. Pela anĆ”lise do dendrograma observou-se a existĆŖncia de 6 clusters para uma percentagem de similaridade de 98%, os quais foram agrupados de acordo com o tipo AFLP previamente atribuĆdo. A relaĆ§Ć£o de similaridade mais afastada encontrada entre os 47 isolados foi de 67%. Considerando a totalidade dos isolados provenientes da regiĆ£o da Serra da Estrela, foi possĆvel identificar 5 tipos AFLP, quatro dos quais identificados apenas naquela zona e um quinto tipo AFLP com uma distribuiĆ§Ć£o geogrĆ”fica alargada (Serra da Estrela, Serpa e SĆ£o Jorge), o que contraria a sua utilizaĆ§Ć£o como marcador geogrĆ”fico. Comparando estes 47 perfis com os obtidos anteriormente pelo mesmo mĆ©todo usando isolados provenientes das zonas produtoras de queijo de Castelo Branco e Tolosa (n=61), concluise que os tipos AFLP obtidos sĆ£o diferentes, nĆ£o havendo tipos AFLP comuns entre as zonas de Tolosa, Castelo Branco e Serra da Estrela, indicando uma associaĆ§Ć£o entre um determinado tipo AFLP de L. monocytogenes ser. 4b e cada uma destas regiƵes. | por |
| dc.description.abstract | ABSTRACT: The serotype more frequently associated with Listeria monocytogenes strains isolated from Portuguese cheeses belongs to serotype 4b, which is reported as responsible for the largest number of human listerioses outbreaks. Given the importance of these strains, their characterization by more discriminatory methods than serotyping is of crucial importance. Thus, the aim of the present study was the molecular characterization of strains of L. monocytogenes ser. 4b, isolated from cheese from different parts of the country, and the assessment of the geographical distribution of molecular types found. Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) method was used based onto a protocol that is in operation at the Health Protection Agency Department of Gastrointestinal Infections / Centre for Infections in London. Cluster analysis was performed using the Bionumerics software. The discriminatory power of AFLP method was calculated using the Simpson index. The 47 strains of L. monocytogenes ser. 4b typed in this work resulted in six different profiles with 5-7 bands in the range between 500 bp and 1500 bp. All AFLP profiles showed a common band of about 850 bp. The discriminatory power of AFLP method was calculated in 0.70. The analysis of the dendrogram showed the existence of six clusters for a percentage of similarity of 98%, which were grouped according to the AFLP previously assigned. The similarity relation farthest found among 47 isolates was 70%. Considering all of the isolates from Serra da Estrela, it was possible to identify five types AFLP, four of them identified only in that area and a fifth AFLP with a wide geographical distribution (Serra da Estrela, Serpa and SĆ£o Jorge), which dissuaded its use as a geographic marker. Comparing these 47 profiles with those obtained previously by the same method and isolated from cheese production areas of Castelo Branco and Tolosa (n = 61), we conclude that the obtained AFLP types are different, with no common AFLP types among the areas of Tolosa, Castelo Branco and Serra da Estrela, indicating an association between a particular AFLP type of L. monocytogenes ser. 4b and each one of these regions of cheese production. | en |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.3/1093 | |
| dc.language.iso | por | por |
| dc.subject | Listeria monocytogenes | por |
| dc.subject | Biologia Molecular | por |
| dc.subject | Queijo | por |
| dc.subject | Marcador GeogrƔfico | por |
| dc.subject | Cheese | por |
| dc.subject | Geographical Marker | por |
| dc.subject | Molecular Biology | por |
| dc.title | CaracterizaĆ§Ć£o molecular de Listeria monocytogenes ser. 4b por Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) | por |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | por |
| rcaap.type | masterThesis | por |