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Genetic diversity of Porpitidae (Cnidaria, Hydrozoa) in the Azores
| datacite.subject.fos | Ciências Naturais::Ciências Biológicas | pt_PT |
| datacite.subject.fos | Ciências Naturais::Ciências da Terra e do Ambiente | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Gonçalves, João Manuel dos Anjos | |
| dc.contributor.advisor | Moura, Carlos Filipe Justo | |
| dc.contributor.author | Leonardes, Francisca Oliveira | |
| dc.date.accessioned | 2023-02-22T16:57:25Z | |
| dc.date.available | 2023-02-22T16:57:25Z | |
| dc.date.issued | 2022-10-19 | |
| dc.description | Dissertação de Mestrado, Estudos Integrados dos Oceanos, 19 de outubro de 2022, Universidade dos Açores. | pt_PT |
| dc.description.abstract | Porpitidae é uma família de hidrozoários neustónicos pouco investigados geneticamente, onde a maioria das publicações menciona somente a sua ocorrência. Para estudar a diversidade desta família nos Açores, foram recolhidos 277 indivíduos em praias de duas ilhas (Faial e São Miguel) e morfologicamente identificados como Velella velella ou Porpita porpita. Para confirmar a identificação das espécies e investigar a sua diversidade genética, associações filogeográficas e a estrutura da população, as amostras foram sequenciadas utilizando três marcadores moleculares diferentes: COI, 16S e ITS. O dispositivo MinION (Oxford Nanopore Technologies) foi utilizado, proporcionando uma sequenciação de leitura longa e rápida em tempo real. Foram construídas redes de haplótipos e árvores filogenéticas. A análise das sequências revelou diversidade genética dos Porpitidae nos Açores. No entanto, a variabilidade intra-género foi praticamente nula no gene nuclear (ITS) quando comparada com os genes mitocondriais (COI e 16S). Comparando com sequências disponíveis nas bases de dados, foi possível verificar uma maior semelhança com os indivíduos amostrados em locais mais próximos dos Açores (Mediterrâneo e Mar dos Sargassos). Nos genes com elevada diversidade genética, também foi possível distinguir dois indivíduos do género Porpita que exibiam uma distância genética significativa quando comparados com outros do mesmo local. Apesar da análise da delimitação das espécies ter apresentado resultados diferentes para ambos os métodos, o resultado sugeriu que podem existir duas a dezasseis espécies, mas há uma maior possibilidade de haver apenas duas espécies. Este estudo forneceu informações importantes ao nível taxonómico da família Porpitidae. Através deste trabalho foi conhecida uma boa representação da diversidade genética dos Porpitidae. Embora o número de indivíduos amostrados seja bastante grande, a baixa representação geográfica das amostras relativamente à distribuição dos géneros pode condicionar os resultados. Seria importante investigar indivíduos de outros locais e utilizar outros marcadores para providenciar informações mais completas. | pt_PT |
| dc.description.abstract | ABSTRACT: Porpitidae is a family of neustonic hydrozoans scarcely investigated genetically, with most scientific publications mentioning solely their occurrence. In order to study the diversity of this family in the Azores, a total of 277 individuals were analysed. These animals were collected on beach areas of two islands (Faial and São Miguel) and morphologically identified as Velella velella or Porpita porpita. To confirm species identification and to investigate their genetic diversity, phylogeographic associations and population structure, the samples were sequenced using three different molecular markers: COI, 16S and ITS. The MinION (Oxford Nanopore Technologies) sequencing device was utilized, providing long and fast reading sequencing in real-time. Haplotype networks and phylogenetic trees were built. The analysis of the sequences revealed genetic diversity in the Porpitidae in the Azores. However, the intra-genus nucleotidic variability was practically null in the nuclear gene (ITS) when compared to mitochondrial genes (COI and 16S). When confronting with other sequences available in the databases, it was possible to verify a greater similarity with individuals sampled in locations closer to the Azores (Mediterranean and Sargasso Sea). In the genes with high genetic diversity, it was also possible to distinguish two sampled Porpita individuals, which exhibited a high genetic distance compared to the others. Although the species delimitation analysis exhibited different results in both methods, the outcome suggested that there may exist two to sixteen species, but there is a higher possibility that there are only two species. This study provided important information at the taxonomic level of the Porpitidae family. Through this work, a good representation of the genetic diversity of Porpitidae was known. Although the number of individuals sampled was quite large, the low geographical representation of the samples in relation to the distribution of the genera may condition the results. It would be important to investigate individuals from other locations as well as to use other molecular markers in order to provide more complete information. | en |
| dc.identifier.citation | Leonardes, Francisca Oliveira (2022). "Genetic diversity of Porpitidae (Cnidaria, Hydrozoa) in the Azores", 77 p.. Mestrado em Estudos Integrados dos Oceanos. Horta: Universidade dos Açores. [Consult. Dia Mês Ano]. Disponível em www:<http://hdl.handle.net/10400.3/6628> | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 203131037 | pt_PT |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.3/6628 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.subject | Porpitidae (Cnidaria, Hydrozoa) | pt_PT |
| dc.subject | Genética | pt_PT |
| dc.subject | Hidrozoários | pt_PT |
| dc.subject | Medusa | pt_PT |
| dc.subject | Genetic | en |
| dc.title | Genetic diversity of Porpitidae (Cnidaria, Hydrozoa) in the Azores | en |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.name | Mestrado em Estudos Integrados dos Oceanos | pt_PT |